검찰은 "여 전 사령관이 '이송이나 구금하라는 지시 없이 맹목적으로 출동했다고 진술해줄 수 있는 부대원 몇 명에게 그렇게 메모하도록 하라'고 말했다"는 방첩사 간부의 진술을 확보했다.
여인형 전 방첩사령관은 12.3 비상계엄이 실패로 돌아간 뒤 이튿날 아침 8시 반쯤 주요 간부들을 모은 자리에서 체포대상자가 적힌 명단을 파기하고, 수사에 대비해 가짜 메모를 만들라는 지시가 내려졌다는 진술을 확보했다.
오전 10시쯤에는 김대우 단장을 통해 사령관 지시가 전파됐다.
또 다른 방첩사 간부의 검찰 진술에서 "김 단장이 사령관님 지시라며 계급별로 똑똑한 애들 한두 명씩 골라 우리한테 유리하게 메모해놓고, 나중에 수사기관 조사받을 때 제출하도록 하라'고 전화했다"고 했다.
"현장에 간 부대원들은 목적이나 임무 없이 간 거다, 체포 명단도 없었다는 취지로 메모해 두라"는 지시였다.
하지만 검찰 수사에서 비상계엄 당시 이재명 민주당 대표 체포조를 시작으로 모두 10개 팀 49명이 국회에 투입된 것으로 드러났다.
현장에서 "이재명, 한동훈, 우원식 먼저 검거하라"는 지시를 받은 체포조 중 한 명은 "정치인 체포는 불법인 줄 알고 있었다, 부대원들이 이용당한 게 개탄스럽다"고 검찰에 진술했다.
검찰은 "김 단장으로부터 사령관님이 명단은 모르는 것으로 하겠다, 명단을 파기하라고 지시했다"는 말을 들었다는 또 다른 방첩사 간부의 진술도 확보했다.